A logomarca do Projeto Inovação se apresenta de forma moderna, leve e dinâmica, ressalta a ideia de Brasil – de um lado por ser de uma instituição pública e de outro pela valorização de nosso país. O conceito de crescimento e de desenvolvimento acompanham a logo. O uso da cor verde, cor da saúde, da tranquilidade, da eficiência junto com  o laranja (uma cor jovem, ousada e quente) com tonalidade amarelada reforçam as cores  do Brasil.